علم الجينوم التحليلي والمتحرك

يوفر المورد المشترك للجينوميات التحليلية والمتحولة (ATG) خدمات تسلسل الجيل التالي والخدمات الأخرى المتعلقة بالجينوم لأعضاء مركز السرطان بجامعة UNM والمستخدمين الآخرين في UNM والمؤسسات التابعة لها. تتضمن الخدمات الأولية تسلسل الجيل التالي ، باستخدام جهازي Ion Proton S5 / XL ، ودعم المعلومات الحيوية الخبير المرتبط بها. يتضمن ذلك سلسلة RNA-seq العادية ، وحيدة الخلية RNA-seq باستخدام نظام 10x الجينوم ، وتسلسل الحمض النووي المستهدف ، و ChIP-seq ومجموعة متنوعة من المقايسات الأخرى ، والتي يمكن إجراء العديد منها إما بالخلايا أو الأنسجة الحية أو المجمدة أو عينات مؤرشفة (مثل FFPE). تعتبر أدوات Ion Proton S5 / XL مناسبة بشكل خاص لتحليل RNA رديء الجودة ، على سبيل المثال من مادة FFPE ، والتي يصعب أو يستحيل تحليلها باستخدام تقنيات أخرى. تولد الأدوات ما يصل إلى 100 مليون قراءة لكل شريحة تسلسلية ، ونحن نسعى جاهدين لتوفير تحول سريع ، إن أمكن. تضيف ATG مُسلسِلًا جديدًا لـ Singular Genomics G4 في أواخر عام 2022 ، والذي سيوسع بشكل كبير خدمات التسلسل من الجيل التالي المتاحة داخليًا.

يتم دعم المورد المشترك من قبل مركز UNM للسرطان ، بما في ذلك المنحة الأساسية CCSG P30CA118100 وصناديق أخرى ، بالإضافة إلى أموال من دولة شمال البحر الأبيض المتوسط ​​ورسوم المستخدم.

يتوفر الموظفون الخبراء للاستشارات لمساعدة المستخدمين على تصميم أفضل التجارب الممكنة ، لزيادة جودة البيانات التي يتم إنتاجها.

د. نيس (يسار) وطاقم علم الجينوم

مدير الكلية

سكوت أ، دكتوراه
دكتور جامعى، الطب الباطني/ الطب الجزيئي
المكتب: CRF 121؛ هاتف: (505) 272-9883

المدير الفني / المعلوماتية الحيوية

كاثرين (تشارلي) براير ، دكتوراه

كبار الموظفين الفنيين

كيل كوك CRF 118 هاتف: (505) 272-5564
جنيفر وودز CRF 121 هاتف: (505) 272-3464
ماجي سافيري CRF 121 هاتف: (505) 272-2464