مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة

يتم تمويل مستودع الأنسجة البشرية والموارد المشتركة لتحليل الأنسجة (HTR-TASR) بشكل مشترك من قبل مركز السرطان وقسم علم الأمراض. لقد تم إنشاؤها لتسهيل البحث الانتقالي لأعضاء هيئة التدريس في مركز السرطان ، وقسم علم الأمراض ، وكلية الطب وعبر المعاهد. يصف هذا الموقع الخدمات المقدمة وتفاصيل الاتصال بموظفي HTR-TASR الذين يمكنهم تقديم المشورة بشأن توفر العينات وجميع جوانب الأنسجة والأمراض الجزيئية.

الهدف

لتسهيل الحصول على عينات من الأنسجة البشرية عالية الجودة وتخزينها وتوزيعها على باحثي UNM لاستخدامها في التحقيقات العلمية مع مراعاة المبادئ واللوائح الأخلاقية والعلمية والتشريعية المناسبة.

نستخدم أفضل ممارسات NCI لموارد البيوسبيس كدليلنا.

حول HTR-Tissue

المورد المشترك HTR-Tissue:

  • يفيد المرضى في المستقبل من خلال السماح للباحثين بالوصول إلى الأنسجة المحفوظة جيدًا والتي قد لا تكون متاحة بخلاف ذلك
  • فوائد UNM HSC من خلال تعزيز مهمة توفير رعاية جيدة للمرضى من خلال تعزيز البحوث المبتكرة والقيمة سريريًا
  • وظيفة الوسيط الصادق لـ HTR في الاستغناء عن عينات مجهولة الهوية خالية من 18 معرّفًا شخصيًا HIPAA تحمي الباحثين من مضاعفات / انتهاكات HIPAA المحتملة

يوفر TASR مجموعة متنوعة من خدمات الأنسجة، بما في ذلك أنواع مختلفة من تلطيخ المناعي والتألق المناعي ، وكذلك مختلف تقنيات علم الأمراض الجزيئي مثل PCR و Real-Time PCR و DNA و RNA استخراج من الأنسجة والسوائل والتألق المناعي.

ملخص خدمات HTR-TASR لطلبات المنح

يمتلك مستودع الأنسجة البشرية والموارد المشتركة لتحليل الأنسجة (HTR-TASR) القدرة على أداء عدد من التقنيات ويقدم مجموعة متنوعة من الخدمات مقابل رسوم مقابل الخدمة.

يجمع HTR-TASR الأنسجة الطبيعية والورم المتطابقة بشكل أساسي من العينات الجراحية المتبقية ، ويخزنها إما مجمدة أو ككتل بارافين مثبتة بالفورمالين (FFPE). يمكن للمحققين طلب الأنسجة ، بالموافقات المطلوبة من IRB (مكتب حماية البحوث البشرية) ولجنة الإشراف على أبحاث الأنسجة (TROC ، SRC سابقًا).

يمكن أن يوفر HTR-TASR أيضًا عددًا من خدمات الأنسجة والجزيئات المختلفة ، مثل التقسيم وتلطيخ H&E والكيمياء المناعية والتألق المناعي باستخدام منصة Ventana Discovery Ultra ، وإنشاء مصفوفات الأنسجة الدقيقة (TMAs) ، ورقمنة الشرائح (حقل مشرق وفلوريسنت) عبر Aperio Versa 200 وتحليل الصور باستخدام HALO ™ Platform (من Indica Labs ، المقر الرئيسي في Albuquerque ، نيو مكسيكو).

تتوفر أنواع مختلفة من معالجة الدم ، بما في ذلك أداء عدد الخلايا والقدرة على البقاء عبر جهاز Nexelom Cellometer 1000.

يحتاج بعض المحققين إلى عينات معدة خصيصًا أو لديهم متطلبات عينات محددة. بالنسبة لهذه الدراسات المعتمدة ، سيقوم موظفو HTR بجمع العينات بشكل مستقبلي والعملية المصممة لاحتياجات الباحثين. بالإضافة إلى ذلك ، تتوفر بعض الخدمات الجزيئية ، مثل استخراج DNA و RNA و PCR و PCR في الوقت الحقيقي. يجب عقد اجتماع جدوى مع المدير الفني ومدير العمليات لمناقشة الخدمات المطلوبة.

للإقرار باستخدام هذا المورد المشترك ، يرجى تضمين ما يلي في منشوراتك:

تم دعم هذا البحث جزئيًا من قبل منحة دعم مركز السرطان الشامل بجامعة نيو مكسيكو NCI P30CA118100 واستفاد من مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة ، والذي يتلقى دعمًا إضافيًا من كلية الطب بجامعة نيو مكسيكو ، قسم علم الأمراض.

اتصل بـ HTR-Tissue

الهاتف: (505) 272-1127
البريد الإلكتروني: fabricbank@salud.unm.edu
غرف Fitz Hall 306B و 306C
كلية الطب UNM HSC
قسم علم الأمراض
MSC 08-4640
915 Camino de Salud، NE
البوكيرك، نيو مكسيكو 87131

موظفو HTR-TA

دينيس ماكانس ، دكتوراهدينيس جي ماكانس دكتوراه

أستاذ باحث ، علم الأمراض

المدير العلمي

يشرف على جميع جوانب المورد

إدغار فيشر ، دكتوراه في الطبإدغار فيشر MD

أستاذ علم الأمراض

المدير الطبي

يشرف على جوانب مراقبة الجودة للمورد

كاثلين مارتينيز ، بكاثلين مارتينيز با

المدير الفني

يشرف على الجوانب الفنية للمورد

سادي لا بوف ، دكتوراهسادي لا بوف دكتوراه

أخصائي عمليات

يدير المسؤوليات اليومية

فريد شولتز ، ماجستيرفريد شولتز ، ماجستير

إدارة المعلوماتية

خدمات علم الأنسجة والأمراض الجزيئية

معالجة الأنسجة ودمج البارافين أو التجميد المفاجئ للأنسجة. يمكن أن تتلطخ الأنسجة ببقعة H&E أو تظل غير ملطخة.

يمكن للمختبر أن يلطخ أقسام الأنسجة بالأجسام المضادة القياسية باستخدام البروتوكولات الموجودة بالفعل. بدلاً من ذلك ، يمكن للمختبر عمل الأجسام المضادة باستخدام منصة VENTANA DISCOVERY التي تسمح بتركيبات تلطيخ متعددة لتحسين نتائج التلوين.

HER-2 وصورة ER
تلطيخ مزدوج لـ HER-2 و ER

يمكن أيضًا استخدام الأجسام المضادة ذات العلامات الفلورية للكشف عن البروتين الذي يهمك.

ميكروأرس الأنسجة HTR - e-cadherin

تصميم المصفوفة الدقيقة للأنسجة والبناء: يستلزم ذلك جمع كتل البارافين المانحة ، واختيار المجالات التي تهم اللب ، ووضع النوى في كتلة فارغة من البارافين المستلم. المزايا في السرعة والتكلفة ، حيث يمكن تقييم عينات متعددة على شريحة واحدة. يحتوي محول المواد الشفافة النموذجي على ما يقرب من 50 إلى 200 مركز بقطر 0.6 مم إلى 2.0 مم. يمكن الحصول على ما يقرب من 50 قسمًا من كتلة TMA واحدة.

 

(إلى اليمين: E-cadherin)

يمكن لموظفي HTR-TASR استرداد كتل الأنسجة الأرشيفية من مستشفى UNM.

يشتمل هذا عادةً على جمع الأنسجة الزائدة أو المتبقية المتبقية في وقت الاستئصال الجراحي بعد أخذ عينات التشخيص للمراجعة المجهرية لأخصائي علم الأمراض الجراحي ويتم الاحتفاظ بعينة كافية في البارافين للاختبار المستقبلي المحتمل لرعاية المريض. سيقوم موظفو HTR-TASR بجمع الأنسجة في غرفة التشريح الإجمالي في علم الأمراض الجراحي التابع لجامعة UNM HSC. في الوقت الحالي ، لا يقوم HTR بإجراء عمليات بزل الوريد ، ولكنه سيخزن مثل هذه العينات حسب طلب الباحثين.

يمكن لمستشاري مشروع HTR-TASR جمع بيانات علم الأمراض والبيانات السريرية التي تم تجريدها من معرفات HIPAA أثناء ترميزها إلى عينات مطابقة.

  1. عزل الحمض النووي والحمض النووي الريبي من أنواع متعددة من العينات (على سبيل المثال ، الدم الطازج / المجمد ، والخلايا المحولة ، والأنسجة المجمدة ، والأنسجة المضمنة بالبارافين) ؛ بما في ذلك تقدير الكميات والجودة للجيش الملكي النيبالي.
  2. تضخيم تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) من أهداف DNA أو RNA ، بما في ذلك تصميم التمهيدي ، وتحسين PCR ، وإعداد PCR و RT-PCR ، والهلام الكهربائي لضمان الجودة.
  3. تقدير كمية التعبير الجيني (PCR في الوقت الحقيقي): بما في ذلك التصميم التمهيدي.

تحليل الصور

يتم التقاط صور H&E أو أقسام الأنسجة الملطخة المناعي أو أقسام التألق المناعي على الماسح الضوئي الرقمي Leica Versa 200 وتحميلها على برنامج HALO للتصوير والتعليقات التوضيحية.

يسمح لك برنامج HALO بتعليق الأنسجة (الورم ، والسدى ، والعضلات ، والدهون ، وما إلى ذلك) ثم عد الخلايا الإيجابية للبروتين المفضل (الشكل ، الأيمن) داخل كل منطقة من هذه المناطق المشروحة. سيمكنك أيضًا من تحليل وقياس تفاعلات الجار الأقرب.

يشتمل البرنامج على أداة لصنع الأشكال يمكنها إنشاء صور متعددة اللوحات للصور بتنسيقات قابلة للنشر بما في ذلك الإطارات المرجعية وشريط المقياس

صورة النتائج الكمية

يوضح هذا الرقم القياس الكمي لتلطيخ Ki67 في سرطان الثدي. تُظهر اللوحة العلوية اليسرى عينة ميكروأري الأنسجة ، وتُظهر اللوحة الوسطى تلطيخًا Ki67 (بني) بدون علامة HALO واللوحة اليمنى تُظهر نفس الصورة باستخدام علامة HALO.

تُظهر العلامات تلطيخًا منخفض المستوى (أصفر) وتلطيخًا معتدلًا (بنيًا) ومستويات عالية (حمراء) من Ki67 في نواة الخلايا السرطانية. تلطيخ الأزرق هي خلايا سلبية لـ Ki67. يمكن للبرنامج عد تلطيخ Ki67 بشكل مستقل في فغرة الورم.

يعرض الجدول قراءة من عدد ونسبة الخلايا في كل فئة تلطيخ ويظهر الرسم البياني توزيع التلوين.

كيفية التقديم للعينات

تواصل معا كاثي مارتينيز or سادي لابوف لجدولة.

افتح حسابك في iLab:

  1. انتقل إلى صفحة تسجيل الدخول إلى iLabs.
  2. في الزاوية العلوية اليمنى من الشاشة ، حدد شارك بالرسائل الإلكترونية
  3. أكمل استمارة التسجيل في صفحة التسجيل.
  4. تلقي بريد إلكتروني ترحيبي من iLab مع بيانات اعتماد وتعليمات تسجيل الدخول

طلب الخدمات في iLab:

  1. قم بإنشاء طلب شراء (PR) من خلال إدارتك. أرسل العلاقات العامة بالبريد الإلكتروني إلى سابرينا ساموديو رويز و أبيل تارانجو برييتو تطلب إضافته تحت مختبرك في نظام iLab.
  2. انتقل إلى تسجيل الدخول إلى iLabs .
  3. في الزاوية العلوية اليمنى من هذه الصفحة ، أدخل اسم المستخدم وكلمة المرور.
  4. ضمن علامة التبويب "طلب الخدمات" ، انقر على "بدء الطلب" بجوار الخدمة محل الاهتمام (مستودع الأنسجة البشرية مقابل خدمات علم الأمراض الجزيئية).
  5. أكمل النموذج وقدم معلومات الدفع لطلبك قبل تقديم الطلب إلى HTR.
    1. تأكد من تطابق عنوان المشروع وأرقام TROC / HRRC / IACUC مع تلك الموجودة في خطابات الموافقة الخاصة بك.
    2. تحت كل فئة من فئات الخدمات ، أدخل الرقم المطلوب وانقر فوق علامة التبويب "إضافة الخدمات المحددة". ستتم إضافة الخدمات في أسفل النموذج.
    3. استخدم مربع "معلومات إضافية" لإضافة أي تفاصيل مهمة ، وإرفاق / تحميل أي مستندات ذات صلة ، مثل قائمة العينات أو وصف الاتجاه.
  6. ستكون الطلبات في انتظار المراجعة بواسطة HTR ، والتي ستجري أي تغييرات ضرورية وإرسالها مرة أخرى للحصول على موافقتك. ستتلقى رسالة بريد إلكتروني من iLab بخصوص طلب مشروعك المحدث.
  1. قدم اقتراحك إلى لجنة الإشراف على أبحاث الأنسجة (TROC). الاتصال كارين كابوبيانكو للحصول على إرشادات في هذه العملية.
  2. بمجرد موافقة TROC على اقتراحك ، أرسل خطاب الموافقة مع طلبك إلى UNM لجنة مراجعة البحوث البشرية (HRRC) مجلس المراجعة المؤسسية (IRB).

للتنقل في عملية تطبيق IRB:

  1. على الرابط أعلاه ، انقر فوق الزر "انقر فوق IRB" على اليسار
  2. انقر فوق علامة التبويب IRB في الجزء العلوي من الشاشة
  3. انقر فوق الزر "إنشاء دراسة جديدة" الموجود على اليسار
  4. املأ الاستمارة
  5. في السؤال رقم 7 ، انقر فوق الارتباط للذهاب إلى المكتبة وحدد البروتوكول المناسب لدراستك
    1. إذا كانت دراستك تتطلب فقط مواد غير محددة الهوية ، فحدد بروتوكول استثناء الفئة 4 (HRP-582). * ملاحظة: قد لا تتطلب المناديل الورقية التي لم يتم التعرف عليها الموافقة
    2. إذا كانت دراستك لا تتطلب الحصول على أي معلومات حول الأفراد الأحياء ، فحدد بحث غير بشري (HRP-585)
    3. يمكنك تقديم طلب عاجل إذا كانت دراستك تتضمن فقط عينات تم جمعها فقط لأغراض غير بحثية (مثل العلاج الطبي والتشخيص)
  6. بعد موافقة HRRC ، قم بتقديم طلب مناديل إلى HTR من خلال iLab. ستقوم بتحميل خطابات الموافقة SRC و IRB الخاصة بك ، وسيكون لديك علاقات عامة نشطة في النظام.
  1. اتصل بـ HTR-TASR لجلسة التخطيط / الجدوى.
  2. قدم اقتراحك إلى لجنة الإشراف على أبحاث الأنسجة (TROC). الاتصال كارين كابوبيانكو للحصول على إرشادات حول هذه العملية.
  3. بمجرد موافقة TROC على اقتراحك ، أرسل خطاب الموافقة مع طلبك إلى مجلس المراجعة المؤسسية (IRB) التابع للجنة مراجعة البحوث البشرية (HRRC) التابعة لـ UNM (انظر التعليمات أعلاه).
  4. اتصل بـ HTR-TASR للحصول على جلسة تخطيط إضافية (عادة ما تكون مطلوبة لتوضيح تفاصيل العملية. يتضمن هذا الاجتماع الحصول على موافقة من رئيس قسم علم الأمراض الجراحي لضمان توافر العينات مع الحفاظ على الامتثال للوائح المختبر الوطنية وأفضل رعاية للمرضى.
  5. إذا كان لديك نسيج متبقي بعد إغلاق التحقيق ، فيجب عليك إعادته إلى HTR
  1. يجب أن تحصل على موافقة من لجنة مراجعة البحوث البشرية المحلية إذا كان من المحتمل استخدام أي جزء من الأنسجة التي تم جمعها للبحث.
  2. يجب أن يوافق رئيس قسم علم الأمراض الجراحية أو من ينوب عنهم على طريقة جمع العينات لضمان الاحتفاظ بأنسجة تمثيلية كافية للرعاية السريرية

المخزون

موقع جمع الأنسجة

(بما في ذلك الأنسجة الأرشيفية من UNM والمجموعة المرتقبة للمحققين لدراسات محددة.)

  • المثانة والدم والعظام ونخاع العظام والدماغ والثدي
  • جدار الصدر ، القولون والمستقيم
  • غشاء
  • المرارة
  • الرأس والعنق
  • كلوي
  • الكبد والرئة والعقدة الليمفاوية
  • المنصف
  • Omentum ، المبيض
  • البنكرياس ، القضيب ، الصفاق ، البروستاتا
  • اللعاب والغدد اللعابية والجلد والأمعاء الدقيقة والأنسجة الرخوة والطحال والمعدة
  • الخصية ، الغدة الصعترية ، الغدة الدرقية
  • الرحم وعنق الرحم
  • المهبل / الفرج

سجل سرطان الثدي الموسع (EBCR)

هذه مجموعة أنسجة معقدة تتكون من أكثر من 400 مريض موافق عليه مع نقاط زمنية متعددة وأنواع من الأنسجة التي تم جمعها. تم جمع ما يلي عن كل مريض:

  • 5 حصص مصل كحد أقصى / مشارك / مجموعة (مثل وقت الأساس أو FUP)
  • 10 قسامات بلازما كحد أقصى / مشارك / مجموعة
  • 10 قسامات DNA من دم كامل / مشارك / مجموعة
  • 2 قسامات الحمض النووي بحد أقصى من غسول الفم أو المسحة / المشارك / الجمع
  • أنسجة الثدي (شفاطات إبرة رفيعة ، قوارير وقوالب OCT) - كل الحالات مختلفة.

يرجى الاتصال بـ HTR-TASR للحصول على استعلام أكثر تفصيلاً عن مجموعة البيانات هذه.