مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة

يُدار مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة (HTR-TA) بشكل مشترك من قِبل مركز السرطان الشامل بجامعة نيو مكسيكو وقسم علم الأمراض. مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة هو معتمدة من قبل الكلية الأمريكية لعلماء الأمراض (CAP).

أُنشئت منصة الموارد المشتركة HTR-TA لتسهيل البحث التطبيقي لأعضاء هيئة التدريس في مركز السرطان بجامعة نيو مكسيكو، وقسم علم الأمراض، وكلية الطب، وسائر المعاهد. يصف هذا الموقع الإلكتروني الخدمات المُقدمة وبيانات الاتصال بأعضاء فريق الموارد المشتركة HTR-TA، الذين يُمكنهم تقديم المشورة بشأن توافر العينات وجميع جوانب علم الأنسجة وعلم الأمراض الجزيئي.

الهدف

يدعم مورد مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة (HTR-TA) المشترك أبحاث السرطان الأساسية والانتقالية من خلال توفير أنسجة الورم والأنسجة الطبيعية المطابقة إما على شكل عينات مجمدة أو مثبتة بالفورمالين ومغموسة بالبارافين (FFPE) للمستخدمين.

حول الموارد المشتركة HTR-TA

الموارد المشتركة HTR-TA:

  • يفيد المرضى في المستقبل من خلال السماح للباحثين بالوصول إلى الأنسجة المحفوظة جيدًا والتي قد لا تكون متاحة بخلاف ذلك
  • فوائد UNM HSC من خلال تعزيز مهمة توفير رعاية جيدة للمرضى من خلال تعزيز البحوث المبتكرة والقيمة سريريًا
  • وظيفة الوسيط الصادقة لمورد HTR-TA المشترك في توزيع العينات مجهولة الهوية الخالية من معرفات HIPAA الشخصية الثمانية عشر تحمي الباحثين من المضاعفات/الانتهاكات المحتملة لـ HIPAA

يوفر مورد HTR-TA المشترك العديد من الأساسيات خدمات الأنسجة، بما في ذلك:

  • معالجة الأنسجة وتضمين البارافين،
  • التقطيع،
  • صبغ الهيماتوكسيلين والإيوزين،
  • iالتصوير المناعي الكيميائي والتصوير الرقمي، و
  • تحليل المقاطع الملطخة بالإضافة إلى تخزين عينات الأنسجة وإطلاقها.

تُجمع الأنسجة بعد الحصول على الموافقة اللازمة. وتُحفظ في قاعدة بيانات تحتوي أيضًا على معلومات مرتبطة بالمريض (مثل الاسم، وتاريخ الميلاد، والفئات الديموغرافية التي حددها بنفسه)، ومصدر الأنسجة وتشخيصها، ومتغيرات أخرى، بما في ذلك طريقة جمع الأنسجة، وحالات نقص التروية، وكيفية معالجة الأنسجة بعد استلامها من قِبل مساعد التقييم.

يضم HTR-TA حاليًا أكثر من 60,000 ألف عينة بيولوجية، مع أكثر من 20,000 ألف عينة بيولوجية مجمدة وأكثر من 17,000 ألف عينة بيولوجية FFPE وأكثر من 7,000 آلاف عينة دم (دم كامل، مصل، بلازما، وخلايا مجمدة ومحفوظة بالتبريد).

تعكس مجموعة أنسجة HTR-TA السكان داخل منطقة مستجمعات المياه التابعة لـ UNMCCC.

ملخص خدمات الموارد المشتركة HTR-TA لطلبات المنح

يتمتع مورد مستودع الأنسجة البشرية وتحليل الأنسجة (HTR-TA) المشترك بالقدرة على إجراء عدد من التقنيات ويقدم مجموعة متنوعة من الخدمات على أساس الرسوم مقابل الخدمة.

يجمع مورد HTR-TA المشترك أنسجةً سليمةً وأورامًا متطابقة، بشكلٍ أساسي، من العينات الجراحية المُهمَلة المتبقية، ويُخزَّن إما مُجمَّدةً أو ككتلٍ مُغطاةٍ بالبارافين مُثبَّتةٍ بالفورمالين (FFPE). يُمكن للباحثين طلب هذه الأنسجة، شريطة الحصول على موافقاتٍ من مكتب حماية الأبحاث البشرية (IRB) ولجنة المراجعة العلمية (SRC).

يمكن أن يوفر مورد HTR-TA المشترك أيضًا عددًا من الخدمات النسيجية والجزيئية المختلفة، مثل التقطيع وتلوين H&E، والمناعة الكيميائية والمناعة الفلورية باستخدام منصة Ventana Discovery Ultra، وإنشاء مجموعات الأنسجة المخصصة (TMAs)، ورقمنة الشرائح (brightfield) عبر Aperio AT2، وتحليل الصور باستخدام منصة HALO ™ (من Indica Labs، المقر الرئيسي في ألباكيركي، نيو مكسيكو).

تتوفر أنواع مختلفة من معالجة الدم ، بما في ذلك أداء عدد الخلايا والقدرة على البقاء عبر جهاز Nexelom Cellometer 1000.

يحتاج بعض الباحثين إلى عينات مُعدّة خصيصًا أو لديهم متطلبات خاصة. لهذه الدراسات المُعتمدة، سيقوم موظفو الموارد المُشتركة في HTR-TA بجمع العينات مُسبقًا ومعالجتها بما يتناسب مع احتياجات الباحثين. ينبغي عقد اجتماع دراسة جدوى مع المدير الفني لمناقشة الخدمات المطلوبة.

للإقرار باستخدام هذا المورد المشترك ، يرجى تضمين ما يلي في منشوراتك:

تم دعم هذا البحث جزئيًا من خلال منحة دعم مركز السرطان الشامل التابع لجامعة نيو مكسيكو NCI P30CA118100 وتم الاستفادة من مستودع الأنسجة البشرية وموارد تحليل الأنسجة المشتركة، والتي تتلقى دعمًا إضافيًا من قسم علم الأمراض بكلية الطب بجامعة نيو مكسيكو.

اتصل بمورد HTR-TA المشترك

الهاتف: (505) 272-1127
البريد الإلكتروني: fabricbank@salud.unm.edu
غرف Fitz Hall 306B و 306C
كلية الطب UNM HSC
قسم علم الأمراض
ام اس سي 08-4640
915 Camino de Salud، NE
البوكيرك، نيو مكسيكو 87131

معايير المستودع والاعتماد

في مركز الموارد المشتركة التابع لجامعة نيو مكسيكو (UNM HTR-TA)، نلتزم بالحفاظ على أعلى معايير إدارة العينات الحيوية، وضمان الجودة، والرقابة الأخلاقية. وتلتزم عملياتنا بإرشادات صارمة وأفضل الممارسات التي وضعتها منظمات وطنية ودولية رائدة.

  • المعهد الوطني للسرطان (NCI) - فرع أبحاث المستودعات الحيوية والعينات الحيوية (BBRB)
    نحن نلتزم بمعايير BBRB أفضل الممارسات لموارد العينات البيولوجية، والتي تقدم إرشادات شاملة بشأن جمع العينات البيولوجية ومعالجتها وتخزينها وتوزيعها لضمان الاتساق والنزاهة العلمية.
    https://biospecimens.cancer.gov/default.asp
  • الجمعية الدولية للمستودعات البيولوجية والبيئية (ISBER)
    يتوافق HTR مع ISBER أفضل الممارسات للمستودعات، وهو إطار عمل معترف به دوليًا لإدارة وحوكمة المستودعات البيولوجية التي تدعم الأبحاث في العلوم البيولوجية والبيئية.
    https://www.isber.org/page/BPR
  • برنامج اعتماد المستودعات الحيوية التابع للكلية الأمريكية لعلماء الأمراض (CAP)
    تفتخر شركة HTR بالحصول على الاعتماد من قبل CAP من خلال برنامج اعتماد المستودعات الحيوية الخاص بها، والذي يثبت امتثالنا للمعايير الرائدة في الصناعة في جودة العينات الحيوية، وإمكانية التتبع، والتميز التشغيلي.
    https://www.cap.org/laboratory-improvement/accreditation/biorepository-accreditation-program

وتضمن هذه المعايير أن العينات الحيوية والخدمات التي نقدمها تدعم الأبحاث عالية الجودة والقابلة للتكرار وتساهم بشكل هادف في التقدم في علم السرطان ورعاية المرضى.

الموارد البشرية المشتركة لـ HTR-TA

جوستي-نانسي-cc.jpgنانسي جوست ، دكتوراه في الطب

أستاذ ورئيس قسم علم الأمراض

المدير الطبي

يشرف على جوانب مراقبة الجودة للمورد

كاثلين مارتينيز ، بكاثلين مارتينيز با

المدير الفني

يشرف على الجوانب الفنية للمورد

فريد شولتز ، ماجستيرفريد شولتز ، ماجستير

إدارة المعلوماتية

خدمات علم الأنسجة والأمراض الجزيئية

معالجة الأنسجة وتضمين البارافين وتقسيم البارافين، بالإضافة إلى التجميد المفاجئ للأنسجة والتقسيم المجمد. تلطيخ H&E على البارافين والأقسام المجمدة.

يمكن للمختبر أن يلطخ أقسام الأنسجة بالأجسام المضادة القياسية باستخدام البروتوكولات الموجودة بالفعل. بدلاً من ذلك ، يمكن للمختبر عمل الأجسام المضادة باستخدام منصة VENTANA DISCOVERY التي تسمح بتركيبات تلطيخ متعددة لتحسين نتائج التلوين.

HER-2 وصورة ER
تلطيخ مزدوج لـ HER-2 و ER
ميكروأرس الأنسجة HTR - e-cadherin

تصميم المصفوفة الدقيقة للأنسجة والبناء: يستلزم ذلك جمع كتل البارافين المانحة ، واختيار المجالات التي تهم اللب ، ووضع النوى في كتلة فارغة من البارافين المستلم. المزايا في السرعة والتكلفة ، حيث يمكن تقييم عينات متعددة على شريحة واحدة. يحتوي محول المواد الشفافة النموذجي على ما يقرب من 50 إلى 200 مركز بقطر 0.6 مم إلى 2.0 مم. يمكن الحصول على ما يقرب من 50 قسمًا من كتلة TMA واحدة.

 

(إلى اليمين: E-cadherin)

يمكن لموظفي الموارد المشتركة في HTR-TA استرجاع كتل الأنسجة الأرشيفية من مستشفى UNM.

عادةً ما يشمل ذلك جمع الأنسجة الزائدة أو المتبقية من عملية الاستئصال الجراحي، بعد أخذ عينات تشخيصية للفحص المجهري من قِبل أخصائي علم الأمراض الجراحي، وحفظ عينة كافية في البارافين لإجراء فحوصات مستقبلية محتملة لرعاية المريض. سيقوم موظفو الموارد المشتركة في HTR-TA بجمع الأنسجة في غرفة التشريح الكلي بقسم علم الأمراض الجراحي في جامعة نيو مكسيكو. حاليًا، لا يُجري قسم الموارد المشتركة في HTR-TA وخز الوريد، ولكنه سيُخزّن هذه العينات بناءً على طلب الباحثين.

 يمكن لمستشاري مشروع الموارد المشتركة HTR-TA جمع البيانات المرضية والسريرية التي تم تجريدها من معرفات HIPAA أثناء ترميزها للعينات المطابقة.

تحليل الصور

يتم التقاط صور H&E أو أقسام الأنسجة الملطخة المناعية على الماسح الضوئي الرقمي Leica AT2 وتحميلها على برنامج HALO للتصوير والشرح.

يسمح لك برنامج HALO بتعليق الأنسجة (الورم ، والسدى ، والعضلات ، والدهون ، وما إلى ذلك) ثم عد الخلايا الإيجابية للبروتين المفضل (الشكل ، الأيمن) داخل كل منطقة من هذه المناطق المشروحة. سيمكنك أيضًا من تحليل وقياس تفاعلات الجار الأقرب.

يشتمل البرنامج على أداة لصنع الأشكال يمكنها إنشاء صور متعددة اللوحات للصور بتنسيقات قابلة للنشر بما في ذلك الإطارات المرجعية وشريط المقياس

صورة النتائج الكمية

يوضح هذا الرقم القياس الكمي لتلطيخ Ki67 في سرطان الثدي. تُظهر اللوحة العلوية اليسرى عينة ميكروأري الأنسجة ، وتُظهر اللوحة الوسطى تلطيخًا Ki67 (بني) بدون علامة HALO واللوحة اليمنى تُظهر نفس الصورة باستخدام علامة HALO.

تُظهر العلامات تلطيخًا منخفض المستوى (أصفر) وتلطيخًا معتدلًا (بنيًا) ومستويات عالية (حمراء) من Ki67 في نواة الخلايا السرطانية. تلطيخ الأزرق هي خلايا سلبية لـ Ki67. يمكن للبرنامج عد تلطيخ Ki67 بشكل مستقل في فغرة الورم.

يعرض الجدول قراءة من عدد ونسبة الخلايا في كل فئة تلطيخ ويظهر الرسم البياني توزيع التلوين.

كيفية التقديم للعينات

الإتصال كاثي مارتينيز لجدولة.

افتح حسابك في iLab:

  1. انتقل إلى صفحة تسجيل الدخول إلى iLabs.
  2. في الزاوية العلوية اليمنى من الشاشة ، حدد شارك بالرسائل الإلكترونية
  3. أكمل النموذج الموجود في صفحة التسجيل. في حال وجود مشاكل في إعداد حساب iLab أو الوصول إليه، يُرجى التواصل مع بالاكشي ريدي باندابالي أو 505-272-4539.
  4. تلقي بريد إلكتروني ترحيبي من iLab مع بيانات اعتماد وتعليمات تسجيل الدخول

طلب الخدمات في iLab:

  1. انتقل إلى تسجيل الدخول إلى iLabs .
  2. في الزاوية العلوية اليمنى من هذه الصفحة ، أدخل اسم المستخدم وكلمة المرور.
  3. تحت علامة التبويب "طلب الخدمات"، انقر فوق "بدء الطلب".
  4. قم بإكمال النموذج وتقديم معلومات الدفع الخاصة بطلبك قبل إرسال الطلب إلى مورد HTR-TA المشترك.
    1. تأكد من أن عنوان المشروع وأرقام SRC/HRRC/IACUC تتطابق مع تلك المذكورة في خطابات الموافقة الخاصة بك.
    2. تحت كل فئة من فئات الخدمات ، أدخل الرقم المطلوب وانقر فوق علامة التبويب "إضافة الخدمات المحددة". ستتم إضافة الخدمات في أسفل النموذج.
    3. استخدم مربع "معلومات إضافية" لإضافة أي تفاصيل مهمة ، وإرفاق / تحميل أي مستندات ذات صلة ، مثل قائمة العينات أو وصف الاتجاه.
  5. ستخضع الطلبات للمراجعة من قِبل مورد HTR-TA المشترك، والذي سيجري أي تغييرات ضرورية ويعيد إرسالها إليك للموافقة عليها. ستتلقى بريدًا إلكترونيًا من iLab بخصوص طلب مشروعك المُحدّث.
لاستخدام العينات التي تم تخزينها مسبقًا:
  1. أرسل مقترحك إلى لجنة المراجعة العلمية (SRC). اتصل بإرنستين أرميجو للحصول على إرشادات في هذه العملية.
  2. أكمل طلب SRC (HRP-224)، مع جميع التوقيعات المطلوبة وقم بتقديمه إلى SRC.
  3. بمجرد موافقة SRC على اقتراحك، قم بإرسال خطاب الموافقة مع طلبك إلى UNM لجنة مراجعة البحوث البشرية (HRRC) مجلس المراجعة المؤسسية (IRB).

للتنقل في عملية تطبيق IRB:

  1. في الرابط أعلاه، انقر على زر "irb.health.unm.edu" الموجود في أسفل الصفحة.
  2. انقر فوق علامة التبويب IRB في الجزء العلوي من الشاشة
  3. انقر فوق الزر "إنشاء دراسة جديدة" الموجود على اليسار
  4. املأ الاستمارة
  5. في السؤال رقم 7، انقر على رابط "مكتبة IRB" واختر البروتوكول المناسب لدراستك.
    1. إذا كانت دراستك تتطلب موادًا مجهولة الهوية فقط، فاختر بروتوكول الفئة المعفاة 4 (HRP-582). *ملاحظة: قد لا تتطلب الأنسجة المهملة مجهولة الهوية موافقة.
    2. إذا كانت دراستك لا تتطلب الحصول على أي معلومات حول الأفراد الأحياء ، فحدد بحث غير بشري (HRP-585)
    3. يمكنك تقديم طلب عاجل إذا كانت دراستك تتضمن فقط عينات تم جمعها فقط لأغراض غير بحثية (مثل العلاج الطبي والتشخيص)
  6. إذا كنت بحاجة إلى مساعدة في التنقل عبر عملية تقديم طلب IRB أو مساعدة في تحديد البروتوكول الذي يلبي احتياجات مشروعك بشكل أفضل، فيرجى اتصل بإرنستين أرميجو للحصول على المساعدة.

بعد موافقة مجلس البحوث الصحية (HRRC)، قدّم طلب أنسجة إلى مورد HTR-TA المشترك عبر iLab. سيُطلب منك تحميل خطابات موافقة مجلس البحوث الصحية (SRC) ومجلس المراجعة المؤسسي (IRB)، كما سيُطلب منك تقديم طلب شراء (PR) ساري المفعول.

التنقل في iLab:

  1. انتقل إلى صفحة تسجيل الدخول إلى iLabs.
  2. في الزاوية العلوية اليمنى من الشاشة ، حدد شارك بالرسائل الإلكترونية
  3. أكمل النموذج الموجود في صفحة التسجيل. في حال وجود مشاكل في إعداد حساب iLab أو الوصول إليه، يُرجى التواصل مع بالاكشي ريدي باندابالي أو 505-272-4539.
  4. تلقي بريد إلكتروني ترحيبي من iLab مع بيانات اعتماد وتعليمات تسجيل الدخول

طلب الخدمات في iLab:

  1. انتقل إلى تسجيل الدخول إلى iLabs .
  2. في الزاوية اليمنى العليا من الصفحة، انقر فوق "تسجيل الدخول" وأدخل اسم المستخدم وكلمة المرور.
  3. تحت علامة التبويب "طلبات الخدمة"، انقر فوق "بدء الطلب" بجوار طلب خدمة مستودع الأنسجة البشرية وموارد تحليل الأنسجة المشتركة.
  4. أكمل النموذج، بما في ذلك تحميل خطابات الموافقة المناسبة من مجلس البحوث الطلابية/مجلس المراجعة المؤسسية/مجلس رعاية الأطفال والحضانة (IACUC)، ثم اختر رقم الطلب من القائمة المنسدلة. انقر على "إرسال الطلب".
  5. ستكون حالة الطلب قيد المراجعة من قِبل مُراجع HTR. سيتم إجراء التغييرات اللازمة وإعادتها للموافقة عليها.
  6. سيتم إرسال رسائل البريد الإلكتروني من iLab لنقل حالة المشروع.
  1. اتصل بمورد HTR-TA المشترك لجلسة التخطيط/الجدوى.
  2. أرسل مقترحك إلى لجنة المراجعة العلمية (SRC). اتصل بإرنستين أرميجو للحصول على إرشادات حول هذه العملية.
  3. بمجرد موافقة SRC على اقتراحك، أرسل خطاب الموافقة مع طلبك إلى مجلس المراجعة المؤسسية (IRB) التابع للجنة مراجعة البحوث الإنسانية التابعة لجامعة UNM (انظر التعليمات أعلاه).
  4. اتصل بمورد HTR-TA المشترك لعقد جلسة تخطيط إضافية (عادةً ما تكون مطلوبة لتوضيح تفاصيل العملية. يتضمن هذا الاجتماع الحصول على موافقة من رئيس قسم علم الأمراض الجراحية لضمان توفر العينات مع الحفاظ على الامتثال للوائح المختبرات الوطنية وأفضل رعاية للمرضى.
  5. إذا كان لديك أنسجة متبقية بعد إغلاق التحقيق، فيجب عليك إعادتها إلى المورد المشترك HTR-TA.
  1. يجب أن تحصل على موافقة من لجنة مراجعة البحوث البشرية المحلية إذا كان من المحتمل استخدام أي جزء من الأنسجة التي تم جمعها للبحث.
  2. يجب أن يوافق رئيس قسم علم الأمراض الجراحية أو من ينوب عنهم على طريقة جمع العينات لضمان الاحتفاظ بأنسجة تمثيلية كافية للرعاية السريرية

المعرض

موقع جمع الأنسجة

(بما في ذلك الأنسجة الأرشيفية من UNM والمجموعة المرتقبة للمحققين لدراسات محددة.)

  • المثانة والدم والعظام ونخاع العظام والدماغ والثدي
  • جدار الصدر ، القولون والمستقيم
  • غشاء
  • المرارة
  • الرأس والعنق
  • كلوي
  • الكبد والرئة والعقدة الليمفاوية
  • المنصف
  • Omentum ، المبيض
  • البنكرياس ، القضيب ، الصفاق ، البروستاتا
  • اللعاب والغدد اللعابية والجلد والأمعاء الدقيقة والأنسجة الرخوة والطحال والمعدة
  • الخصية ، الغدة الصعترية ، الغدة الدرقية
  • الرحم وعنق الرحم
  • المهبل / الفرج

اتصل بنا للحصول على الأسعار الحالية وقائمة محدثة للأجسام المضادة المحسنة.

سجل سرطان الثدي الموسع (EBCR)

هذه مجموعة أنسجة معقدة تتكون من أكثر من 400 مريض موافق عليه مع نقاط زمنية متعددة وأنواع من الأنسجة التي تم جمعها. تم جمع ما يلي عن كل مريض:

  • 5 حصص مصل كحد أقصى / مشارك / مجموعة (مثل وقت الأساس أو FUP)
  • 10 قسامات بلازما كحد أقصى / مشارك / مجموعة
  • 10 قسامات DNA من دم كامل / مشارك / مجموعة
  • 2 قسامات الحمض النووي بحد أقصى من غسول الفم أو المسحة / المشارك / الجمع
  • أنسجة الثدي (شفاطات إبرة رفيعة ، قوارير وقوالب OCT) - كل الحالات مختلفة.

من فضلك قم الاتصال بالمورد المشترك HTR-TA للحصول على استعلام أكثر تفصيلاً عن مجموعة البيانات هذه.