المعلوماتية الحيوية وعلوم البيانات
يدعم الموارد المشتركة لعلم البيانات والمعلومات الحيوية التابع لمركز الأمم المتحدة لتغير المناخ (BDS) الأبحاث الأساسية والانتقالية والسريرية للسرطان من خلال توفير مجموعة شاملة من الخدمات الحسابية والتحليلية.
تشمل هذه الخدمات
- تصميم وتطوير البحوث،
- تحليل بيانات التسلسل الجيني للجيل التالي (NGS)،
- النسخ الجيني للخلية الواحدة والنسخ المكاني،
- الكيمياء المعلوماتية،
- معلوماتية السرطان، و
- منهجيات متقدمة في الإحصاء وعلوم البيانات.
يعمل أعضاء حركة المقاطعة وسحب الاستثمارات وفرض العقوبات بشكل وثيق مع علم الجينوم التحليلي والترجمة و مبادئ السلوك الإحصاء الحيوي الموارد المشتركة لتعزيز اكتساب المعرفة من NGS وغيرها من البيانات الجينومية والنسخية.
الموارد المشتركة لحركة المقاطعة وسحب الاستثمارات وفرض العقوبات (BDS)
- توفر البنية التحتية الأساسية لتخزين البيانات والحوسبة عالية الأداء والحلول المستندة إلى السحابة - بما في ذلك تكامل AWS من خلال برنامج NIH STRIDES - و
- تدير CRIIS، وهي منصة معلوماتية فريدة من نوعها للسرطان تجمع بين البيانات السريرية والجينومية وسجلات الأورام والبيانات الاجتماعية والديموغرافية والتي تم تطويرها بالتعاون مع شركة تحليل بيانات محلية بدعم من UNMCCC وولاية نيو مكسيكو.
المعلوماتية الحيوية الموارد المشتركة
جيريمي إدواردز ، دكتوراه
المدير المشارك
البريد الإلكتروني للدكتور إدواردز
كريس آموس، دكتوراه
المدير المشارك
كاثرين (تشارلي) براير ، دكتوراه
عالم المعلومات الحيوية ، تحليل البيانات
أولوفونميلولا (فونمي) أويباميجي، MS
عالم المعلومات الحيوية ، تحليل البيانات
إنيجو سان جيل، دكتوراه
أخصائي خدمات تكنولوجيا المعلومات
شيانغجون شياو، MS
كبير علماء البيانات
للإقرار باستخدام هذا المورد المشترك ، يرجى تضمين ما يلي في منشوراتك:
تم دعم هذا البحث جزئيًا من قبل منحة UNM الشاملة لدعم مركز السرطان NCI P30CA118100 والمورد المشترك للمعلومات الحيوية وتحليل البيانات عالية الأبعاد.
الأهداف المحددة لعلم المعلومات الحيوية وعلوم البيانات
الهدف الأول: توفير الدعم في مجال المعلوماتية والتحليلات وإدارة المعرفة من خلال خدمات وتقنيات ومعدات وخبرات فعالة من حيث التكلفة لدعم برامج الأبحاث الثلاثة التابعة لمركز الأمم المتحدة للتغيرات المناخية.
تتمثل أولوية نظام خدمات تطوير الأعمال (BDS) في تزويد أعضاء UNMCCC بالخبرة في تحليل البيانات المعقدة وواسعة النطاق، ودعم البرامج الحاسوبية، والاحتياجات الحاسوبية، والمعرفة التكاملية اللازمة لتحقيق الأهداف البحثية لبرامج UNMCCC البحثية الثلاثة. مع التقدم في علم الجينوم، وخاصةً علم الجينوم المكاني، يتوقع نظام خدمات تطوير الأعمال (BDS) ازدياد الحاجة إلى تحليل بيانات الـ omics المعقدة.
باستخدام نموذج تعاوني، وبالتنسيق مع مجموعة ATG والموارد المشتركة للإحصاء الحيوي، يوفر نظام BDS وسيلةً فعّالة من حيث التكلفة للباحثين لتصميم الدراسات وتحليل البيانات المعقدة والمتخصصة، مما يتيح لهم الوصول إلى معلومات حول أساليب وقدرات تحليل البيانات المتخصصة. بالإضافة إلى ذلك، سيدير نظام BDS إمكانية الوصول إلى أعضاء UNMCCC وتدريبهم على استخدام نظام CRIIS، مع تقديم المشورة بشأن تحليل البيانات وتفسيرها.
الهدف الثاني: تطوير أدوات وأنابيب المعلوماتية الحيوية المخصصة لتناسب احتياجات البحث في UNMCCC.
سيواصل قسم خدمات تطوير الأعمال تطوير أدوات تتوافق بشكل وثيق مع احتياجات أعضاء مركز السرطان، وخاصةً في مجال البيولوجيا المكانية. إضافةً إلى ذلك، سيلعب القسم دورًا محوريًا في تعزيز فائدة نظام CRIIS، من خلال تطوير منصة آمنة لتحليل البيانات وتخزينها وتوزيعها، بما في ذلك معلومات صحية محددة للمرضى وبيانات الجينوم الصادرة عن مركز الأمم المتحدة لتنسيق الجينوم (UNMCCC).
الهدف 3: توفير التعليم وتعزيز الوعي حول تقنيات وخدمات المعلومات الحيوية.
يساهم مديرو خدمات تطوير الأعمال في نشرة إخبارية ربع سنوية تُسلّط الضوء على خدمات وتقنيات خدمات تطوير الأعمال وتشرحها، وتساعد المستخدمين على إعداد مقترحات المنح التنافسية التي تتضمن تحليل بيانات معقدة أو متعددة الأبعاد. يحضر المديرون برنامج البحث واجتماعات مركز الأمم المتحدة للتغيرات المناخية (UNMCCC) الأخرى لتقديم الخبرة والمشورة والمعلومات حول التقنيات والخدمات المتاحة في خدمات تطوير الأعمال، بالإضافة إلى تحديثات حول أحدث مناهج ومنهجيات المعلوماتية الحيوية. يشارك المدير إدواردز بشكل كبير في برنامج الدراسات العليا في المعلوماتية الحيوية الذي تقدمه كلية الهندسة بجامعة نيو مكسيكو، كما يُلقي محاضرات حول المعلوماتية الحيوية في مقرر أساسي لطلاب الدراسات العليا.
الكلية والطاقم
جيريمي إدواردز ، دكتوراه
المدير المشارك للموارد المشتركة لعلم المعلومات الحيوية وعلوم البيانات
أستاذ الكيمياء والبيولوجيا الكيميائية
أستاذ الهندسة الكيميائية والبيولوجية
أستاذ علم الوراثة الجزيئية وعلم الأحياء الدقيقة
التعليم والتدريب
تدريب ما بعد الدكتوراه في علم الوراثة ، كلية الطب بجامعة هارفارد
دكتوراه الهندسة الحيوية ، جامعة كاليفورنيا ، سان دييغو
ماجستير الهندسة الحيوية ، جامعة كاليفورنيا سان دييغو
بكالوريوس هندسة ميكانيكية ، جامعة تكساس أرلينغتون
الاهتمامات البحثية
المعلوماتية الحيوية ، تقنيات الجينوم ، تكنولوجيا تسلسل الجيل القادم ، بيولوجيا الأنظمة ، التنظيم المكاني لمسارات الإشارات.
كريستوفر آموس، دكتوراه
رئيس مبادرات علوم البيانات في HSC
المدير المساعد لقسم السكان وعلوم البيانات في مركز الأمم المتحدة لتغير المناخ
المدير المشارك للموارد المشتركة لعلم المعلومات الحيوية وعلوم البيانات
أستاذ، قسم الطب الباطني، قسم علم الأوبئة والإحصاء الحيوي والطب الوقائي، جامعة نيو مكسيكو
التعليم والتدريب
شهادة البورد في علم الوراثة الطبية
تدريب ما بعد الدكتوراه، برنامج تدريب علم الوراثة الطبية بين المعاهد في المعاهد الوطنية للصحة
دكتوراه في القياسات الحيوية وعلم الوراثة، المركز الطبي بجامعة ولاية لويزيانا
ماجستير في القياسات الحيوية وعلم الوراثة، المركز الطبي لجامعة ولاية لويزيانا
بكالوريوس العلوم، كلية ريد.
الاهتمامات البحثية
ركز الدكتور آموس جزءًا كبيرًا من حياته المهنية على تطوير وتنفيذ أساليب لفهم التأثيرات الجينية والبيئية الكامنة وراء مسببات السرطان الشائعة.